Le profilage transcriptomique permet d’analyser l’expression des gènes afin de mieux comprendre les processus biologiques sous-jacents, qu’il s’agisse de la régulation des voies métaboliques, des réponses aux traitements ou de l’identification de biomarqueurs spécifiques. Ces analyses sont essentielles pour explorer des mécanismes pathologiques, optimiser des stratégies thérapeutiques ou encore caractériser des signatures moléculaires dans divers contextes, de la recherche fondamentale à la médecine personnalisée. Chez GENXMAP, nous proposons plusieurs niveaux de profilage transcriptomique adaptés à vos besoins :
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Approche globale - exploratoire du transcriptome
Une solution complète pour la découverte de biomarqueurs et l'analyse des signatures transcriptomiques globales via Bulk RNA-sequencing, à l'échelle cellulaire via du Single cell RNA-seq
ou en conservant l'architecture spatiale via de la Transcriptomique Spatiale.
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Approche ciblée du transcriptome
Une solution adaptée pour la validation et quantification relative des transcrits via RT-qPCR ou une quantification absolue et une détection de transcrits rares et faiblement exprimés par PCR digitale.
Decoding Gene Expression, Unlocking New Insights
Approche globale: Processus intégré et optimisé
Des analyses précises et exploitables, au service de vos découvertes.
Une approche clé en main avec un accompagnement personnalisé,
de l'extraction à l'analyse des résultats.
1. Extraction et contrôle qualité des échantillons
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Extraction de l’ARN total
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Évaluation de la qualité et de l'intégrité de l’ARN (Bioanalyzer/Tapestation)
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Quantification précise (Qubit, Nanodrop)
2. Préparation des librairies
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Sélection des ARN d'intérêt (polyA, ribo-déplétion selon les besoins)
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Construction de librairies compatibles avec les plateformes Illumina/NovaSeq
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Contrôle qualité des librairies avant séquençage
3. Séquençage à haut debit
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Séquençage en lecture paired-end 2x100 bp ou 2x150 bp
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Profondeur ajustée aux objectifs de l’étude (20 à 100 millions de reads par échantillon)
4. Analyse bioinformatique et biostatistique
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Contrôle qualité des reads (FastQC, trimming)
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Alignement sur le génome de référence
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Quantification des niveaux d'expression (TPM, FPKM, CPM)
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Analyse différentielle d’expression (DESeq2, EdgeR)
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Annotation fonctionnelle et enrichissement de pathways
Projet personnalisé et expertise multi-omique
Options
Accédez à nos solutions de profilage transcriptomiques afin de mieux comprendre les processus biologiques sous-jacents.
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Des Services optimisés et transparents
Nos processus Go/No-Go vous permettent de suivre l'avancement de votre projet en temps réel. À chaque étape, vous validez le passage à la suivante, assurant un contrôle total et garantissant une transparence maximale tout au long du processus.
Nos délais optimisés garantissent une exécution rapide et efficace de chaque projet, tout en respectant vos exigences spécifiques. Ce système assure une gestion proactive du temps, minimisant les retards et maximisant la productivité pour obtenir des résultats conformes à vos attentes.
Nos processus sur mesure sont conçus pour répondre aux besoins uniques de chaque projet, offrant flexibilité et suivi personnalisé. Ce système garantit un contrôle rigoureux tout en assurant des résultats précis et en adéquation avec vos attentes.
Nos analyses détaillées garantissent des résultats fiables et approfondis, adaptés à chaque étude. Grâce à des outils de pointe et des méthodologies éprouvées, nous offrons une compréhension précise des données génétiques, tout en respectant les plus hauts standards de qualité et de rigueur scientifique.
Nos autres solutions
Des services précis et avancés, des technologies de pointe et des analyses fiables.
Notre approche rigoureuse permet d’obtenir des résultats détaillés, essentiels pour vos découvertes scientifiques et applications cliniques.
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Précision, innovation et fiabilité au service de vos découvertes.
Découvrez sur notre blog comment nos technologies de pointe et nos analyses avancées ouvrent de nouvelles perspectives en recherche scientifique et applications cliniques.
