GENXMAP propose un service de séquençage d'ARN en bulk qui offre une vision complète de l'expression génique à partir de tissus ou de populations cellulaires. Cette approche performante permet de quantifier avec précision les niveaux d'ARN, d'identifier les gènes dont l'expression varie et d'explorer des mécanismes complexes tels que l'épissage alternatif. Grâce à ce service, GENXMAP fournit aperçu global sur la régulation et la fonction des gènes, facilitant ainsi une compréhension approfondie des processus biologiques en jeu.
En choisissant GENXMAP pour leurs besoins en séquençage d'ARN, les chercheurs bénéficient d'une expertise de haut niveau et de technologies avancées qui garantissent des résultats fiables et de qualité. Ce service est idéal pour ceux qui souhaitent explorer les dynamiques d'expression génique dans divers contextes, que ce soit pour des études fondamentales ou des applications cliniques. GENXMAP s'engage à soutenir ses clients dans leurs recherches, leur permettant ainsi de faire des avancées significatives dans le domaine de la biologie moléculaire et des sciences de la vie.
Pure RNA, Unlocking Precision Analysis
Des Services optimisés et transparents
Nos processus Go/No-Go vous permettent de suivre l'avancement de votre projet en temps réel. À chaque étape, vous validez le passage à la suivante, assurant un contrôle total et garantissant une transparence maximale tout au long du processus.
Nos délais optimisés garantissent une exécution rapide et efficace de chaque projet, tout en respectant vos exigences spécifiques. Ce système assure une gestion proactive du temps, minimisant les retards et maximisant la productivité pour obtenir des résultats conformes à vos attentes.
Nos processus sur mesure sont conçus pour répondre aux besoins uniques de chaque projet, offrant flexibilité et suivi personnalisé. Ce système garantit un contrôle rigoureux tout en assurant des résultats précis et en adéquation avec vos attentes.
Nos analyses détaillées garantissent des résultats fiables et approfondis, adaptés à chaque étude. Grâce à des outils de pointe et des méthodologies éprouvées, nous offrons une compréhension précise des données génétiques, tout en respectant les plus hauts standards de qualité et de rigueur scientifique.
Details du Service
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Identification des objectifs
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But du projet (question scientifique, conditions, nombre de réplicats biologiques...)
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Type d’échantillons : Nature, nombre, état et disponibilité des échantillons (ARN purifié, cellules, tissus, etc.).
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Définition des paramètres :
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Profondeur de séquençage.
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Couverture génomique.
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Multiplexage (si applicable).
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Validation des ressources :
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Évaluation de la qualité et quantité des échantillons disponibles.
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Conseils sur les étapes de préparation en amont : extraction, purification, contrôle qualité, préparation des librairies
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Définition du budget :
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Discussion sur un budget fixe ou flexible.
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Établissement du calendrier :
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Estimation des délais pour chaque étape.
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Planification des livrables : données brutes, analyses, rapports.
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À l’issue de cette consultation, vous recevrez :
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Une proposition détaillée : méthodes, technologies, budget et calendrier.
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Une stratégie personnalisée pour maximiser la réussite de votre projet.
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Des conseils clairs pour préparer vos échantillons et optimiser les résultats.
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Séquençage haut débit (Next-Generation Sequencing - NGS) : GENXMAP utilise les plateformes suivantes :
NovaSeq (Illumina)
Avantages :
Séquençage rapide et précis de grandes quantités d'ADN provenant de diverses sources environnementales ou biologiques.
Offre une couverture et une profondeur élevées pour une détection précise.
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Étape 0 >> Contrôle de réception des échantillons.
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Evalution visuelle en quantité, qualité
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Rapport et décision client "Go / No-Go" pour la suite du processus
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Étape 1 >> Préparation des Échantillons :
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Extraction de l’ADN/ARN : Des protocoles optimisés pour assurer une extraction de haute qualité, même à partir de types d’échantillons difficiles (tissus FFPE, cellules rares, etc.).
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Quantification et évaluation de la qualité : Vérification de la quantité et de la qualité de l’ADN/ARN extrait à l’aide de spectrophotomètres (Nanodrop), Qubit ou fragment analyzer (Qiaxcel).
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Enrichissement ciblé : Si nécessaire, nous appliquons des techniques d’enrichissement pour cibler certaines régions d’intérêt (par exemple, gènes de résistance, gènes 16S rRNA, etc.) avant de passer au séquençage. L’enrichissement permet de concentrer l’analyse sur des zones spécifiques du génome.
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Préparation de la librairie : Une fois l’ADN extrait et éventuellement enrichi, il est fragmenté, puis les adaptateurs nécessaires pour le séquençage sont ajoutés. Ce processus crée une librairie de séquençage prête à être analysée sur la plateforme choisie.
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Étape 2 >> Lancement du séquençage : Selon la technologie choisie (Illumina, Oxford Nanopore), nous procédons au séquençage sur la plateforme adaptée.
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Étape 3 : Contrôle qualité en temps réel : Surveillance du processus de séquençage pour garantir l'absence d’erreurs techniques et garantir la qualité des données générées.
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Étape 4 >> Analyse des Données :
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Nous proposons différents niveaux d'analyse: primaire, secondaire ou tertiaire en fonction de vos besoins. Nous proposons avec nos partenaire divers types d'analyses telles que:
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Identification taxonomique : Nous utilisons des bases de données comme QIIME, MetaPhlAn, ou Kraken pour identifier les espèces présentes dans l’échantillon et dresser un profil taxonomique détaillé.
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Analyse fonctionnelle : En plus de l'identification taxonomique, nous effectuons une analyse fonctionnelle pour déterminer les gènes et les voies métaboliques présentes dans l'échantillon, notamment les gènes de résistance, les enzymes ou d'autres éléments d'intérêt.
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Assemblage des séquences : Les séquences obtenues sont assemblées et analysées à l’aide de logiciels spécialisés pour reconstruire les génomes des micro-organismes présents dans l’échantillon. Cette étape permet de traiter et de structurer les données brutes.
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Pour en savoir plus, n'hésitez pas à aller vers notre page "Analyses bioinformatique & biostatistique"
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Étape 5 >> Validation et Interprétation :
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Interprétation des données : Nos experts bioinformaticiens et nos partenaires analysent les résultats pour vous fournir une interprétation approfondie. Cette analyse permet de mettre en évidence des relations complexes entre les micro-organismes et d'identifier des biomarqueurs ou des cibles thérapeutiques potentielles.
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Rapports détaillés : Un rapport complet et détaillé est généré, incluant des visualisations des résultats (graphes, arbres phylogénétiques, heatmap, etc.), des conclusions sur la diversité microbienne, ainsi que des recommandations pour les étapes suivantes, en fonction des objectifs du projet.
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Étape 6 >> Livraison des Résultats :
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Formats de Résultats : Fourniture de fichiers bruts (FASTQ), assemblages, résultats taxonomiques, analyses fonctionnelles et métadonnées.
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Rapport Détaillé : Comprend un résumé des résultats, des visualisations (graphiques, arbres phylogénétiques), une interprétation biologique et des recommandations pour les étapes suivantes.
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Modes de Livraison : Accès via une plateforme en ligne sécurisée, envoi par email ou réunion de présentation des résultats.
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Suivi et Support : Assistance post-livraison pour clarifications, révisions ou analyses complémentaires.
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Délais de Livraison : Généralement entre 3 à 6 semaines, en fonction de la complexité du projet.
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Séquençage 16S rRNA
Séquençage 18S rRNA
Séquençage Shotgun
Enrichissement des Échantillons : Avant le séquençage, certaines régions spécifiques du génome peuvent être enrichies (par exemple, les gènes de résistance ou des régions d’intérêt fonctionnel) pour améliorer la couverture de ces régions.
GENXMAP, votre partenaire de confiance pour vous soutenir dans vos recherches
Nos autres solutions
Des services précis et avancés, des technologies de pointe et des analyses fiables.
Notre approche rigoureuse permet d’obtenir des résultats détaillés, essentiels pour vos découvertes scientifiques et applications cliniques.
Découvrez notre blog
Précision, innovation et fiabilité au service de vos découvertes.
Découvrez sur notre blog comment nos technologies de pointe et nos analyses avancées ouvrent de nouvelles perspectives en recherche scientifique et applications cliniques.
L'expression génique dans toute sa complexité
Optimisez vos découvertes avec notre service de séquençage d'ARN en bulk. Accédez à des données précises sur l'expression génique grâce à des technologies de pointe et à notre expertise, pour des résultats fiables et exploitables.
Séquençage d'ARN messagers ou d'ARN totaux
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Analyse complète et flexible du transcriptome : Capturez l’ensemble des ARN codants et non codants avec une compatibilité étendue aux différents types d’échantillons.
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Qualité et rentabilité pour tous les projets : Obtenez des données robustes et reproductibles, adaptées aux études de toute taille, avec une solution économique pour l’analyse de l’expression génique.
Séquençage d'ARN Micro et Petit
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Détection sensible et analyse complète des petits ARN : Quantifiez avec précision les miARN rares et explorez l’ensemble des petits ARN présents dans un échantillon.
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Annotation précise et applications biomédicales : Identifiez de nouveaux ARN, reliez-les aux voies régulatrices et découvrez des biomarqueurs non invasifs pour des avancées thérapeutiques.
